VšĮ Alytaus šv. Benedikto gimnazija savo veiklą grindžia Lietuvos Respublikos Konstitucija, Lietuvos Respublikos švietimo ir kitais įstatymais, Lietuvos Respublikos Vyriausybės nutarimais, Švietimo ir mokslo ministerijos teisės aktais ir Reikalavimų valstybinių ir savivaldybių mokyklų nuostatams pagrindu parengtais įstaigos nuostatais.
Pagrindiniai dokumentai, reglamentuojantys gimnazijos veiklą: